Aarhus University Seal / Aarhus Universitets segl

2021

Yuki Koyanagi

Cand.scient. Yuki Koyanagi forsvarer torsdag den 11. marts, 2020, kl 15:15 sin ph.d.-afhandling The Fatgraph Models of Proteins and Their Applications in The Protein Folding Problem ved et offentligt forsvar. Forsvaret afholdes online. For at modtage et link til begivenheden, send venligst en e-mail til Randi Mosegaard, randi@math.au.dk.

I løbet af sit ph.d.-studium har Yuki Koyanagi arbejdet med fatgraf-modeller af proteiner. En fatgraf kan betegnes som en graf bestående af skiver og bånd, i modsætning til punkter og kanter i en normal graf. Yuki Koyanagi brugte fatgraf-modellen til at finde en formel, der rekursivt udregner antallet af teoretisk mulige proteinstrukturer. Han har også forsket i forskellige anvendelser af modellen, herunder udvælgelse af ”bedste match” blandt mange forudsigelser af proteinstrukturen, forudsigelse af proteiners lokale strukturer, samt strukturel analyse af beta-ark, som er et hyppigt mønster,

De opnåede forskningsresultater bidrager til den teoretiske forståelse af optællingsproblemet af bestemte strukturer, såvel som at demonstrere potentialet af denne matematiske model i forskningen af proteinstrukturer.